De game Mass Effect zal zich afspelen in een verre toekomst, waar een oeroude legende rondgaat die verteld over het uitsterven van het universum. Het universum wordt vastgehouden door een onophoudelijke cyclus van 50.000 jaar, die elke keer eindigt door de hand van oeroud machine ras. Met nog nooit geziene efficiency en meedogenloosheid worden alle geavanceerde levensvormen vernietigd. Ze laten een spoor van vernietiging achter, zonder ook maar enig bewijs van hun bestaan achter te laten. Weinig mensen geloven in deze legende, maar jij weet dat het waar is. Het wordt jouw gevecht, jouw missie om het universum te redden van deze vernietiging, het uitsterven van het universum. Jij bent Commander Shepard van de SS Normandy en alleen jij weet wat er allemaal gaande is. Jij zult op pad gaan met je elite recon squad om dit kwaadaardig machine ras tegen te gaan, ten koste van alles. Want alleen jij weet wat er zal gebeuren als jij zult falen. Al met al is dit een ijzersterk verhaal. Een kwaadaardig machine ras, het uitsterven van het universum en jij bent de enige die ervan af weet. Een succes formule gegarandeerd. Door dit verhaal zal jij als speler door het hele universum moeten reizen en zeer uiteenlopende missies volbrengen om het universum van het noodlot te weerhouden.
