Een groot verschil tussen concurrenten FIFA200X en PESX is toch wel het gebruik van soundtracks. Daar waar PES vaak een standaard soundtrack heeft gebruikt EA veel bekende songs in diens game. Zo ook in FIFA2006. Men gaf de volgende songlist uit van de game:
3D Voz: Fiesta (Spain)
AK4711: Rock (Germany)
ATHENA: Tam Zamani Simdi (Turkey)
Bloc Party: Helicopter (UK)
Blues Brother Castro: Flirt (Netherlands)
boTECOeletro: Coco Nutz Mass (Brazil)
Boy: Same Old Song (Canada)
Carlinhos Brown & DJ Dero: Nabika (Brazil/Argentina)
Damian ‘Jr. Gong’ Marley: Welcome To Jamrock (Jamaica)
Dogs: London Bridge (UK)
Doves: Black and White Town (UK)
Duels: Potential Futures (UK)
Embrace: Ashes (UK)
Hard-Fi: Gotta Reason (UK)
Jamiroquai: Feels Just Like it Should (UK)
Kaos: Now and Forever (Germany)
Kinky: Coqueta (Mexico)
K’naan: Soobax (Somalia)
KYO: Contact (France)
LCD Soundsystem: Daft Punk Is Playing At My House (UK)
Linea 77: Inno All’Odio (Italy)
Mando Diao: God Knows (Sweden)
maNga: Bir Kadin Cizeceksin (Turkey)
Marcelinho da Lua: Tranqüilo (Brazil)
Nine Black Alps: Cosmopolitan (UK)
Oasis: Lyla (UK)
Paul Oakenfold: Beautiful Goal (UK)
Röyksopp: Follow My Ruin (Norway)
Selasee: Run (Ghana)
SoShy: The Way I (France)
Subsonica: Corpo a Corpo (Italy)
Teddybears Sthlm: Cobrastyle (Sweden)
The Departure: Be My Enemy (UK)
The Film: Can You Touch Me (France)
The Gift: 11.33 (Portugal)
The Gipsys: La Discoteca (France)
The Rakes: Strasbourg (UK)
Vitalic: My Friend Dario (France)
Yerba Buena: Cityzen Citysoy (USA)
