Er zijn aanwijzingen dat Nintendo en Monolith Soft de rechten op de Xenosaga-franchise mogelijk hebben overgenomen van Bandai Namco. Die speculatie ontstond nadat het personage MOMO als speelbare Blade verscheen in de overview-trailer van Xenoblade Chronicles 2: Nintendo Switch 2 Edition, zonder dat daarbij een licentievermelding van Bandai Namco werd getoond. Daarnaast is Xenosaga vorig jaar verdwenen uit het Japanse merkenoverzicht van Bandai Namco, net als Baten Kaitos.
Ook de Japanse productpagina van Xenoblade Chronicles 2: Nintendo Switch 2 Edition noemt alleen Nintendo en Monolith Soft als rechthebbenden. Tegelijkertijd staat Bandai Namco nog altijd vermeld als ontwikkelaar en rechthebbende van de onlangs op Steam verschenen versie van Xenosaga: Pied Piper. Daardoor is het nog onduidelijk of de rechten daadwerkelijk zijn overgedragen of dat er een andere verklaring is. Nintendo en Bandai Namco hebben vooralsnog geen reactie gegeven op de geruchten.
