Het leek lang twijfelachtig of Zelda: Twilight Princess wel speelbaar zou zijn met de Wii-Mote maar dit blijkt dus achteraf toch te kunnen. Nu is het maar afwachten of de besturing ook daadwerkelijk voordelen te bieden heeft. Nintendo Dream hield een interview dat te lezen is op IGN over het spel met de heer Miyamoto. Hieruit blijkt dat men de besturing heeft weten te veranderen van de game. In de E3 demo gebruikte spelers namelijk nog de B-knop om met het zwaard van Link te kunnen zwaaien, in de uiteindelijke versie zal dit gerealiseerd worden door simpelweg enkel met het zwaard te zwaaien. Hierdoor hoopt men wat meer realisme te kunnen creëren in de game.
Verder is ook het schieten met de pijl en boog verandert. Op de E3 moest dit namelijk nog met het D-pad, daar kun je nu dus de B-knop voor gebruiken, die normaal gesproken dus ergens anders voor bedoeld was in het verleden. Miyamoto gaf toe dat het met de D-pad wat te ingewikkeld was om daarmee te schieten. Het is nog niet duidelijk of je kunt kiezen tussen beide stuurmogelijkheden, wel gaf hij te kennen het liefst de Wii versie te spelen, al wordt ook de GameCube versie volgens hem fantastisch.