We zitten inmiddels in het jaar 2047, en er staat meer op het spel dan je denkt. De Aarde ligt dit keer onder een dikke laag besmettelijke radioactieve Tiberium, een waardevol goedje, maar eveneens een heel gevaarlijk goedje. De GDI, een hightech alliantie van de meest geavanceerde naties ter wereld, probeert van alles om deze plaag van Tiberium te stoppen. De leider van NOD, Kane, heeft echter heel andere plannen met het Tiberium. Hij wil met het Tiberium namelijk chaos en verderf zaaien op de Aarde. Zijn NOD organisatie is namelijk uitgegroeid tot een supernatie die er alles aan doet om de macht te krijgen over de hele planeet en alle rijkdommen die zich maar bevinden op onze kleine planeetje. Nu Kane zo zijn supermacht heeft, is het natuurlijk onvermijdelijk dat er geen oorlog kan uitbreken. En dat gebeurt dan dus ook samen met de Aliens die zich bemoeien met het grote gevecht om de Tiberium.
Inmiddels zijn er nieuwe screens verschenen van deze EA uitgave, welke volgende maand geïntroduceerd zal gaan worden voor de PC en Xbox 360. Deze zijn als volgt: